Parti passer un an dans la jungle avec sa tante Diane afin d'en étudier la faune et la flore, Hector, un jeune garçon en quête d’aventure, est devenu le meilleur copain du légendaire Marsupilami et de sa famille. Au milieu des animaux, dans ce prétendu « Enfer vert », Hector s'est découvert une nouvelle famille amusante et excitante, mi humaine mi Marsu. Mais un jour, cette vie joyeuse dans la jungle est mise en danger par l'arrivée de l'industrielle mégalomane Felicia Devort. Rongée par la haine et le chagrin, milliardaire excentrique, Felicia n'a qu'une idée en tête : raser la jungle Palombienne pour y construire une titanesque mégalopole de béton à son nom, la Devort City. Sous l'œil bienveillant de Tante Diane, le Marsu et l'enfant vont combattre les projets de Felicia. Ils vont sauver la Palombie, leur maison, et leur liberté…