Dans les eaux tropicales de la grande barrière de corail, Marin, un poisson clown, mène une existence paisible avec son fils unique, Nemo. Redoutant l'océan, il fait de son mieux pour protéger son fils. Comme tous les petits poissons, celui-ci rêve d'aventure. Lorsque Nemo disparaît, Marin devient malgré lui le héros d'une quête palpitante. Il ignore que son rejeton a échoué dans l'aquarium d'un dentiste. Marin, avec l'aide de Dory, un poisson chirurgien bleu à la mémoire défaillante, affrontera de nombreux dangers, mais l'optimisme de Dory poussera Marin à surmonter toutes ses peurs.